故事发生在未来世界之中，彼时，一种凭空出现的名叫“HUGE”的生命体让人类的命运走到了濒临灭绝的边缘。就在此时，世界各国联合起来发明了能够同HUGE抗衡的武器，而只用这些武器的少女面则被称之为莉莉。　　很快，在世界各地便建立起了培养莉莉的专门学校“Garden”，每个学校都有着自己的名字和特点，我们的女主角一柳梨璃（赤尾光 培养）便就读于百合丘女学院。待人冷淡极具个性的白井梦结（夏吉优子 配音）、含着金汤匙出生的千金大小姐努韦尔（井泽美香子 配音）、拥有超高智商和广阔的知识面的二川二水（西本里美 配音），在学校里，梨璃结识了这些并肩作战的同伴们。

高中生四月一日君寻（福山润 配音）有着令他十分困扰的灵异体质，他总是能在不知不觉的情况下吸引大量的灵体。一日，偶然中他踏进了一间魔法商店，遇见了美丽神秘的店主壹原郁子（大原沙耶香 配音）。郁子告诉他这是一件帮人达成愿望的商店，四月一日君寻遂许下了希望能解除特异体质的愿望，可是这愿望售价昂贵，四月一日君寻不得不在店里打工来付清欠款。此间，他结实了沉默寡言的白目鬼静（中井和哉 配音）、厄运缠身的九轩葵（伊藤静 配音），以及一只造型怪异的名叫魔可拿的宠物。　　在打工的过程中，四月一日君寻接触了一系列与愿望有关的事件，他发现，这个世上有好的愿望，有坏的愿望，有单纯的愿望，却也有无论如何努力都无法达成的愿望。人性、命运、必然、偶然，这一切都在店主壹原郁子的掌控之中。

高中生四月一日君寻（福山润 配音），有着异于常人的体质，他可以看到并且吸引各种鬼怪。他身边的好友百目鬼（中井和哉 配音）和小葵（伊藤静 配音）都是特殊能力者，百目鬼有着驱除妖魔的能力，而小葵则有招来厄运的体质。在命运的牵引下，四月一日闯进了壹原侑子（大原沙耶香 配音）的店里，这是一家可以帮人实现任何愿望的店，但是委托人必须付出对等代价。于是四月一日委托侑子帮他远离鬼怪，作为代价，他留在店里打工。随后，他又结识了一个少女灵能力者，五月七日小羽。　　因为长期留在店里打工，四月一日穿越在次元间，接触到各种不思议现象。而在这一季中，四月一日有了更多切身的经历，他更加清晰地看到了自己和身边人之间息息相关的命运。梦境与现实，前世与未来，原来一切都正如侑子所说的——这个世上没有什么偶然，有的只有必然……

“东京决战”一年后，布里塔尼亚少年鲁路修在11区（原日本国）过着平凡的学生生活。但是，鲁路修与弟弟罗洛的一次出行，遇到了黑色骑士团的余党。在与少女C.C再次结成契约之后，尘封的记忆摆在了鲁路修的面前。　　身为帝国王子的鲁路修，为了建立人人平等的世界、让妹妹娜娜丽幸福的世界，而使用GEASS，令人绝对服从的力量，带领黑色骑士团向帝国宣战。带上假面化名ZERO的他，却在一年前的“东京决战”中被好友朱雀击败，被帝国皇帝抹去了记忆。　　现在，恢复记忆的鲁路修不仅要面对帝国的强大军事力量，更要面对虚假的弟弟罗洛、失踪的妹妹娜娜丽、不知敌友的中华联盟、内部出现分歧的黑色骑士团。面对内忧外患，鲁路修走上了GEASS之力的诅咒——孤独的王之路。

出生于坦克世家的高中少女西住美穗（渕上舞 配音），早已厌烦了被作为传统文化在世界范围内普及、号称修炼女性的“战车道”。为了逃避这个恼人的宿命，美穗特意转学至没有这一科目的大洗，并结交了渴望浪漫爱情的武部沙织（茅野爱衣 配音）和擅长花道的五十铃华（尾崎真实 配音）两位好友。谁知日本即将举行战车道大赛，美穗所在的大戏女子学园也顺应恢复了战车道的科目。由于相关经验学院短缺，在学生会长强迫之下，美穗和两位朋友一同选修战车道。对于这门停滞已久的学科，18名少女们寻找废弃战车、维修护理、进修操作和作战课程、实战演习……，如此等等，一切都从头开始。　　经过一段时间的艰苦磨练，大洗女子学园的少女们驾驶着神采奕奕的战车，开向了高手如云的全国大赛会场……

以若木民喜的同名漫画为原著的动画《只有神知道的世界》宣布第1季在2011年1月4日起在日本重播的同时，在其连载的漫画杂志《周刊少年 SUNDAY》上宣布推出第二季动画《只有神知道的世界Ⅱ》。擅长恋爱游戏甚至被称为“攻略之神”的少年——桂木桂马在来自冥界的恶魔艾露西的强迫下，与她结下了地狱的契约。两人已经一起成功捕捉了四只驱魂。这一次在二人面前出现了新的驱魂队成员。在这一季里，将会出现新的攻略对象，武术传承者春日楠，现实女孩中的现实女孩小阪千寻以及学校的实习教师长濑纯。攻略故事就由此再一次展开。

由于联合军的阴谋，先帝戈萨十五世陛下驾崩，年少继位的阿萨琳十六世在大臣的极力推动下，发动了对联合宇宙军的全面战争。与此同时，联合宇宙军也在全力备战，招募士兵。在诱人的美女征兵广告前，杰斯迪·植木·泰勒动心了，于是他来到征兵处，面对入伍动机询问，他给出了以下经典回答：军队这种地方，吃饭不要钱，制服和生活日常用品全部都……不要钱！又不用担心房租，要取得各种执照也轻易，再加上搭乘宇宙战舰的话，到达敌方以前整天可以在冷气密封仓里睡觉，同时可以坐着做工作，没有比这更轻松的行业啦！不是吗？同时呀阁下！退役后又有退休年金可以过悠闲的生活，这实在令人向往呀！如此回答，基本上没人会让这种人加入军队的，然后，泰勒的演讲开始了！

马上就要升为初中二年级的未来，在春假的夜晚发现天空中有神秘的物体掉到了附近的公园。”会不会是魔法师呢？“满心期待的未来，第二天一边欢欣雀跃，一边带着心爱的小熊去了公园。她发现骑着扫把浮在空中，自称里子的女孩，是个魔法师！里子声称是为了找寻物品而来到未来的世界的。而面对突然出现的邪恶魔法师，二人的挂件发出光芒，变身为传说中的光之美少女！

游戏业界是一个与现实相异的世界，存在着四个由女神统治的国家：Planeptune、Lastation、Leanbox和Lowee，四个国家为了争夺女神力量之源“Share”而展开长期战争。但是，因惧怕长期战争导致国力衰弱，女神们最终缔结了禁止武力争夺Share的《友好条约》。就这样，游戏业界迈向崭新的未来，四个国家的女神和候补生妹妹也开始了新的生活——。

橘晶（渡部纱弓 配音）拥有着一副冷淡的外表，内心里却是和外表极不相称的天真和单纯。橘曾经是学校田径队的种子选手，却因为种种意外而选择了退出。之后，橘来到了名为“GARDEN”的家庭餐馆打工，餐馆的老板是一个名叫近藤正己（平田广明 配音）的男人，他离过一次婚并且有一个孩子。　　看上去邋里邋遢对什么都不在乎的近藤意外的吸引了橘的注意，渐渐的，橘无可救药的喜欢上了这个年长她28岁的男人。当这份炙热的感情再也无法隐藏之时，橘对近藤表白了，然而，换来的却是对方的拒绝。但橘并没有气馁，她选择以朋友的身份留在近藤的身边，怀揣着小小的期待，期待她如同雨季一样悠长的单恋能够迎来小小的晴天。